招生对象不同、报考次数不同、入学方式不同、学习方式不同、学制不同、毕业条件不同等。自学考试属于成人教育的考试，统招本科属于全日制学历。高等教育自学考试本科招生对象为社会人员，统招本科招生对象为高考生。

入学方式不同

统招本科需要参加全国统一高考而入学，自考本科不需要考生入学，主要是以自学为主。

学习形式不同

统招本科需要采用全日制的学习形式，而自考本科的学习时间比较自由，只需自学然后定期参加考试即可。

学制年限不同

普通本科一般需要4年。自考本科没有规定的拿证时间，考生几年考完全部的考试科目就可以几年申请毕业，最快需要1.5年到2年。

毕业条件不同

统招本科只要修完所有课程并考试合格即可毕业，自考本科则需要有国家承认的大专学历才可以申请毕业等。