1、考试时间不同，长线自考由省考办在每年的4月和10月可以报考两次，无合格时间限制(本科学位申请有特殊要求的除外);短线自考在每学期期末考试，不及格者可参加补考。

2、学习形式不同，长线自考主要是考生自己自学，然后进行考试，而短线自考则是有专门的老师对学生进行辅导，帮助学习。

2、学籍管理不同，长线自考考生只需在县区自考办报名即取得考籍，短线考生则在报考院校报名后，学籍档案在省教委备案。

4、考试及命题方式不同，长线自考由全国考委和省自考委联合出题制卷;短线自考科目设置分为统考课程和校考课程两类，统考课程由自考委组织命题和考试，校考课程由学校命题考试。

5、收费项目和标准不同，长线自考报考费用全省统一;短线自考收费根据主办院校专业设置及开办情况按相关标准进行收费，由于要占用学校教学资源，费用一般比长线要高。

6、考试难度不同长线自考的考卷是由国家出题，考试难度大，通过率低;而短线自考很多是学校自己命题，考试难度小，通过率高。

7、报名地点不同，全日制自考在各举办高校报名，由各举办高校到省教育考试院进行国家统一电子注册;“长线”自考(即面向社会开放式自学考试)则在各地市(县)自考办报名。